MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geobacillus kaustophilus HTA426 plasmid pHTA426

Total Repeats: 760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006509	TGC	2	6	325	330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410438
2	NC_006509	TA	3	6	334	339	50 %	50 %	0 %	0 %	56410438
3	NC_006509	TA	3	6	368	373	50 %	50 %	0 %	0 %	56410438
4	NC_006509	AGG	2	6	378	383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410438
5	NC_006509	GTT	2	6	460	465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410438
6	NC_006509	GTT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410438
7	NC_006509	TAA	2	6	603	608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410438
8	NC_006509	ACA	2	6	742	747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410439
9	NC_006509	AGA	2	6	808	813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410439
10	NC_006509	ATC	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410439
11	NC_006509	ACG	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410439
12	NC_006509	CCT	2	6	1082	1087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56410439
13	NC_006509	GAA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410439
14	NC_006509	GAT	2	6	1215	1220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410439
15	NC_006509	GAT	2	6	1226	1231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410439
16	NC_006509	A	6	6	1272	1277	100 %	0 %	0 %	0 %	56410439
17	NC_006509	AAG	2	6	1296	1301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410439
18	NC_006509	CAT	2	6	1322	1327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410439
19	NC_006509	GAG	2	6	1338	1343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410439
20	NC_006509	GCG	2	6	1365	1370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410439
21	NC_006509	AG	3	6	1386	1391	50 %	0 %	50 %	0 %	56410439
22	NC_006509	GAT	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410439
23	NC_006509	AACAG	2	10	1499	1508	60 %	0 %	20 %	20 %	56410439
24	NC_006509	CGG	2	6	1547	1552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410439
25	NC_006509	TGGA	2	8	1557	1564	25 %	25 %	50 %	0 %	56410439
26	NC_006509	TGAA	2	8	1642	1649	50 %	25 %	25 %	0 %	56410439
27	NC_006509	GATC	2	8	1673	1680	25 %	25 %	25 %	25 %	56410439
28	NC_006509	CCG	2	6	1724	1729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410439
29	NC_006509	AGC	2	6	1765	1770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410439
30	NC_006509	TGC	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410439
31	NC_006509	TGA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410439
32	NC_006509	GAG	2	6	1836	1841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410439
33	NC_006509	GCT	2	6	2028	2033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410440
34	NC_006509	TGA	2	6	2062	2067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410440
35	NC_006509	ATA	2	6	2073	2078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410440
36	NC_006509	AAT	2	6	2092	2097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410440
37	NC_006509	AATA	2	8	2104	2111	75 %	25 %	0 %	0 %	56410440
38	NC_006509	CAA	2	6	2135	2140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410440
39	NC_006509	GCC	2	6	2197	2202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410440
40	NC_006509	GCT	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410440
41	NC_006509	CCG	2	6	2334	2339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410440
42	NC_006509	AAT	2	6	2345	2350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410440
43	NC_006509	T	7	7	2367	2373	0 %	100 %	0 %	0 %	56410440
44	NC_006509	AAAT	2	8	2655	2662	75 %	25 %	0 %	0 %	56410440
45	NC_006509	GGA	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410440
46	NC_006509	GGAT	2	8	2963	2970	25 %	25 %	50 %	0 %	56410441
47	NC_006509	GAA	2	6	2980	2985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410441
48	NC_006509	GAA	2	6	3105	3110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410441
49	NC_006509	GTGGAT	2	12	3143	3154	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56410441
50	NC_006509	GTGG	2	8	3181	3188	0 %	25 %	75 %	0 %	56410441
51	NC_006509	TCA	2	6	3243	3248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410441
52	NC_006509	GGTC	2	8	3411	3418	0 %	25 %	50 %	25 %	56410441
53	NC_006509	GTC	3	9	3440	3448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410441
54	NC_006509	TCC	2	6	3474	3479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56410441
55	NC_006509	GAA	2	6	3529	3534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410441
56	NC_006509	GAA	2	6	3537	3542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410441
57	NC_006509	ATA	2	6	3564	3569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410441
58	NC_006509	TGTTT	2	10	3654	3663	0 %	80 %	20 %	0 %	56410441
59	NC_006509	T	6	6	3661	3666	0 %	100 %	0 %	0 %	56410441
60	NC_006509	GTT	2	6	3681	3686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410441
61	NC_006509	TGA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410441
62	NC_006509	GAT	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410441
63	NC_006509	ATG	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410441
64	NC_006509	GAG	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410441
65	NC_006509	A	6	6	3845	3850	100 %	0 %	0 %	0 %	56410441
66	NC_006509	GAA	2	6	3877	3882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410441
67	NC_006509	GGA	2	6	3916	3921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410441
68	NC_006509	ATT	2	6	3941	3946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410441
69	NC_006509	CGG	2	6	3965	3970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410441
70	NC_006509	GAG	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410441
71	NC_006509	AAC	2	6	4050	4055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410441
72	NC_006509	GGA	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410441
73	NC_006509	ATG	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410441
74	NC_006509	GCG	2	6	4156	4161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410441
75	NC_006509	CAG	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410441
76	NC_006509	TAC	2	6	5273	5278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410442
77	NC_006509	A	6	6	5304	5309	100 %	0 %	0 %	0 %	56410442
78	NC_006509	ATGT	2	8	5311	5318	25 %	50 %	25 %	0 %	56410442
79	NC_006509	TCA	2	6	5324	5329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410442
80	NC_006509	GGA	2	6	5392	5397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410442
81	NC_006509	GTC	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410442
82	NC_006509	TGA	2	6	5502	5507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410442
83	NC_006509	GT	3	6	5534	5539	0 %	50 %	50 %	0 %	56410442
84	NC_006509	TGT	2	6	5634	5639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410442
85	NC_006509	TTG	2	6	5669	5674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410442
86	NC_006509	GC	3	6	5817	5822	0 %	0 %	50 %	50 %	56410442
87	NC_006509	TCA	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410442
88	NC_006509	ACAA	2	8	5996	6003	75 %	0 %	0 %	25 %	56410442
89	NC_006509	CAA	2	6	6017	6022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410442
90	NC_006509	AAC	2	6	6030	6035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410442
91	NC_006509	TTA	2	6	6060	6065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410442
92	NC_006509	AT	3	6	6083	6088	50 %	50 %	0 %	0 %	56410443
93	NC_006509	GGA	2	6	6128	6133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410443
94	NC_006509	AAGC	2	8	6158	6165	50 %	0 %	25 %	25 %	56410443
95	NC_006509	TGA	2	6	6268	6273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410443
96	NC_006509	GAG	2	6	6285	6290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410443
97	NC_006509	TCAA	2	8	6494	6501	50 %	25 %	0 %	25 %	56410444
98	NC_006509	CTG	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410444
99	NC_006509	AGA	2	6	6599	6604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410444
100	NC_006509	GAT	2	6	6674	6679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410444
101	NC_006509	TCAA	2	8	6691	6698	50 %	25 %	0 %	25 %	56410444
102	NC_006509	TG	3	6	6744	6749	0 %	50 %	50 %	0 %	56410444
103	NC_006509	GGAAGT	2	12	6755	6766	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	56410444
104	NC_006509	CTT	2	6	6800	6805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56410444
105	NC_006509	CCG	2	6	6838	6843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410444
106	NC_006509	CA	3	6	6875	6880	50 %	0 %	0 %	50 %	56410444
107	NC_006509	AGA	2	6	7960	7965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410445
108	NC_006509	AAACCA	2	12	7982	7993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410445
109	NC_006509	CAA	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410445
110	NC_006509	GTT	2	6	8035	8040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410445
111	NC_006509	AT	3	6	8068	8073	50 %	50 %	0 %	0 %	56410445
112	NC_006509	T	6	6	8081	8086	0 %	100 %	0 %	0 %	56410445
113	NC_006509	ATT	2	6	8129	8134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410445
114	NC_006509	GAA	2	6	8189	8194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410445
115	NC_006509	GAAA	2	8	8209	8216	75 %	0 %	25 %	0 %	56410445
116	NC_006509	TAT	2	6	8237	8242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410445
117	NC_006509	AGC	2	6	8287	8292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410445
118	NC_006509	TA	3	6	8299	8304	50 %	50 %	0 %	0 %	56410445
119	NC_006509	TGA	2	6	8398	8403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410445
120	NC_006509	TTG	2	6	8448	8453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410445
121	NC_006509	GA	3	6	8476	8481	50 %	0 %	50 %	0 %	56410445
122	NC_006509	ATTTT	2	10	8499	8508	20 %	80 %	0 %	0 %	56410445
123	NC_006509	CCG	2	6	8516	8521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410445
124	NC_006509	GAA	2	6	8579	8584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410445
125	NC_006509	AAG	2	6	8604	8609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410445
126	NC_006509	AAC	2	6	8781	8786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410445
127	NC_006509	TCC	2	6	8839	8844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56410445
128	NC_006509	TAGT	2	8	8949	8956	25 %	50 %	25 %	0 %	56410445
129	NC_006509	TTTG	2	8	9079	9086	0 %	75 %	25 %	0 %	56410445
130	NC_006509	A	6	6	9196	9201	100 %	0 %	0 %	0 %	56410445
131	NC_006509	A	6	6	9251	9256	100 %	0 %	0 %	0 %	56410445
132	NC_006509	ACG	3	9	9294	9302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410445
133	NC_006509	CAA	2	6	9332	9337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410445
134	NC_006509	TAC	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410445
135	NC_006509	TCG	2	6	9493	9498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410445
136	NC_006509	TTG	2	6	9507	9512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410445
137	NC_006509	ATG	2	6	9615	9620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410445
138	NC_006509	TGCT	2	8	9705	9712	0 %	50 %	25 %	25 %	56410445
139	NC_006509	A	7	7	9728	9734	100 %	0 %	0 %	0 %	56410445
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147	NC_006509	ATA	2	6	10298	10303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410446
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154	NC_006509	A	7	7	10613	10619	100 %	0 %	0 %	0 %	56410446
155	NC_006509	CAT	2	6	10621	10626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410446
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180	NC_006509	AT	3	6	11988	11993	50 %	50 %	0 %	0 %	56410447
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264	NC_006509	AAT	2	6	16944	16949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410450
265	NC_006509	TCC	2	6	17472	17477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56410451
266	NC_006509	CCGT	2	8	17522	17529	0 %	25 %	25 %	50 %	56410451
267	NC_006509	GCG	2	6	17566	17571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410451
268	NC_006509	GC	3	6	17605	17610	0 %	0 %	50 %	50 %	56410451
269	NC_006509	CGG	2	6	17636	17641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410451
270	NC_006509	CAAA	2	8	17642	17649	75 %	0 %	0 %	25 %	56410451
271	NC_006509	CGG	2	6	17669	17674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410451
272	NC_006509	GC	3	6	17679	17684	0 %	0 %	50 %	50 %	56410451
273	NC_006509	T	6	6	17841	17846	0 %	100 %	0 %	0 %	56410451
274	NC_006509	GTG	2	6	17878	17883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56410451
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278	NC_006509	GAC	2	6	17979	17984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410451
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281	NC_006509	GCG	2	6	18046	18051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410451
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284	NC_006509	CGC	2	6	18257	18262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410451
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286	NC_006509	GCGG	2	8	18446	18453	0 %	0 %	75 %	25 %	56410451
287	NC_006509	CGGT	2	8	18460	18467	0 %	25 %	50 %	25 %	56410451
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291	NC_006509	ACA	2	6	18771	18776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410452
292	NC_006509	GC	3	6	18841	18846	0 %	0 %	50 %	50 %	56410452
293	NC_006509	GCC	2	6	18890	18895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410452
294	NC_006509	ACA	2	6	18917	18922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410452
295	NC_006509	CCG	2	6	18924	18929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410452
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299	NC_006509	CAA	2	6	19020	19025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410452
300	NC_006509	A	6	6	19028	19033	100 %	0 %	0 %	0 %	56410452
301	NC_006509	CGG	2	6	19045	19050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410452
302	NC_006509	GCA	2	6	19062	19067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410452
303	NC_006509	CGG	2	6	19103	19108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410452
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324	NC_006509	AAT	2	6	20672	20677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410453
325	NC_006509	T	7	7	20700	20706	0 %	100 %	0 %	0 %	56410453
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329	NC_006509	AT	3	6	20900	20905	50 %	50 %	0 %	0 %	56410454
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345	NC_006509	A	6	6	21695	21700	100 %	0 %	0 %	0 %	56410454
346	NC_006509	ATA	2	6	21708	21713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410454
347	NC_006509	GCT	2	6	21803	21808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410454
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351	NC_006509	TC	3	6	22070	22075	0 %	50 %	0 %	50 %	56410454
352	NC_006509	T	6	6	22137	22142	0 %	100 %	0 %	0 %	56410454
353	NC_006509	AG	3	6	22155	22160	50 %	0 %	50 %	0 %	56410454
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359	NC_006509	TGTT	2	8	22529	22536	0 %	75 %	25 %	0 %	56410455
360	NC_006509	CTC	2	6	22611	22616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56410455
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362	NC_006509	AGTAC	2	10	22729	22738	40 %	20 %	20 %	20 %	56410455
363	NC_006509	CAAC	2	8	22762	22769	50 %	0 %	0 %	50 %	56410455
364	NC_006509	GT	3	6	22770	22775	0 %	50 %	50 %	0 %	56410455
365	NC_006509	TAA	2	6	22812	22817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410455
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372	NC_006509	TTC	2	6	23290	23295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56410456
373	NC_006509	A	7	7	23326	23332	100 %	0 %	0 %	0 %	56410456
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375	NC_006509	CTGAT	2	10	23353	23362	20 %	40 %	20 %	20 %	56410456
376	NC_006509	TAG	2	6	23395	23400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410456
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380	NC_006509	TGG	2	6	23773	23778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56410456
381	NC_006509	AGG	2	6	23819	23824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410457
382	NC_006509	GAA	2	6	23865	23870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410457
383	NC_006509	TTA	2	6	23876	23881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410457
384	NC_006509	CCA	2	6	23896	23901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56410457
385	NC_006509	C	6	6	23931	23936	0 %	0 %	0 %	100 %	56410457
386	NC_006509	TATAGG	2	12	23948	23959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410457
387	NC_006509	TCA	2	6	23974	23979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410457
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389	NC_006509	ATT	2	6	24088	24093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410457
390	NC_006509	CAT	2	6	24095	24100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410457
391	NC_006509	CTT	2	6	24230	24235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56410457
392	NC_006509	TCA	2	6	24272	24277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410457
393	NC_006509	TCTTT	2	10	24314	24323	0 %	80 %	0 %	20 %	56410458
394	NC_006509	AGC	2	6	24407	24412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410458
395	NC_006509	AGC	2	6	24654	24659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410458
396	NC_006509	TCTACT	2	12	24717	24728	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	56410458
397	NC_006509	TAA	2	6	24813	24818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410458
398	NC_006509	AC	3	6	24901	24906	50 %	0 %	0 %	50 %	56410458
399	NC_006509	T	6	6	24907	24912	0 %	100 %	0 %	0 %	56410458
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402	NC_006509	GTA	2	6	25203	25208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410458
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495	NC_006509	CGTA	2	8	30926	30933	25 %	25 %	25 %	25 %	56410462
496	NC_006509	T	7	7	30963	30969	0 %	100 %	0 %	0 %	56410462
497	NC_006509	CCAAA	2	10	31367	31376	60 %	0 %	0 %	40 %	56410463
498	NC_006509	ATAC	2	8	31398	31405	50 %	25 %	0 %	25 %	56410463
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